In jedem Versuchsansatz lagern sich die an die an, dann verbinden die die Nukleotide zu komplementären Strängen. Zufälligerweise können an den passenden Stellen in jedem Topf je eine Sorte eingebaut werden. Es entstehen also in einem Topf verschieden lange Fragmente, die aber alle mit derselben Base enden. Die vier verschiedenen Ansätze werden in einer sehr empfindlichen getrennt. Die nach Größe sortierten Fragmente geben die des synthetisierten DNA-Strangs an, die gesuchte DNA ist zu dieser .